好处一

化学肥料养份含量高，肥效快，但持续时间短，养分单一，生物菌肥正好相反，含有有益菌和丰富营养成分，与化肥混用可取长补短，满足作物各个生长期对养分的需要。

好处二

化肥施入土壤后，有些养份被土壤吸收或固定，降低了养份的有效性。而与生物肥料混施后，可以减少化肥与土壤的接触面，减少化肥被土壤固定的几率，提高养份的有效性，而且，生物肥料中的解磷解钾菌可以把被固定的磷和钾变成作物可以吸收的磷和钾。

好处三

一般化肥溶解度大，施用后对土壤造成较高的渗透压，影响作物对养份和水份的吸收，增加养份流失的机会。如与生物菌肥搭配混用，能克服这个弊端，促进作物对养份和水份的吸收。

好处四

如果碱性土壤单一施酸性化肥，铵被植物吸收后，剩下的酸根与土壤中氢离子结合生成酸，会导致酸性增强，土壤板结加剧。如与生物菌肥搭配混用，能提高土壤的缓冲能力，有效地调节酸碱度，使土壤酸性不至增高。

好处五

生物菌肥中的有机质是微生物生活的能源，化肥是供给微生物生长发育的无机营养。两者混用能促进微生物的活力，进而促进有机质的分解。微生物的活动还能产生维生素，生物素，烟碱酸等，增加土壤养份，提高土壤活力，促进作物的生长。